Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD1Q5VV17 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms