Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf135Q5VTT2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms