Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM164Q5U3C3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM164Q5U3C3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM164Q5U3C3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM164Q5U3C3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM164Q5U3C3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM164Q5U3C3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM164Q5U3C3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM164Q5U3C3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM164Q5U3C3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms