Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HES3Q5TGS1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HES3Q5TGS1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms