Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYT6Q5T7P8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms