Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEXMIFQ5QGS0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms