Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A3Q5K4L6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms