Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms