Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms