Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms