Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms