Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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