Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms