Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITSN1Q15811 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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