Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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