Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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SIX1Q15475 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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