Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLR1Q15399 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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