Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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