Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERC3Q15034 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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