Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
R3HDM1Q15032 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
R3HDM1Q15032 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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