Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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GPNMBQ14956 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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GPNMBQ14956 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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