Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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