Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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COL9A3Q14050 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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COL9A3Q14050 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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COL9A3Q14050 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL9A3Q14050 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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COL9A3Q14050 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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COL9A3Q14050 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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COL9A3Q14050 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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COL9A3Q14050 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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COL9A3Q14050 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL9A3Q14050 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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