Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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KCNC3Q14003 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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KCNC3Q14003 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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KCNC3Q14003 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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KCNC3Q14003 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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KCNC3Q14003 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNC3Q14003 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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