Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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