Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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