Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3BQ13214 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms