Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 TPTEP1-204ENST00000426585 5725 ntTSL 1 (best)12.53□□□□□ -0.43e-6■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TLE3-210ENST00000557984 478 ntTSL 228.39■■■□□ 2.144e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 ZNF800-207ENST00000485577 1478 ntTSL 522.75■■□□□ 1.234e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.984e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.814e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.574e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.514e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.513e-15■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 KMT5C-211ENST00000592631 869 ntTSL 318.08■□□□□ 0.484e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.464e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.194e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.174e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 KMT5C-206ENST00000468951 661 ntTSL 315.9■□□□□ 0.144e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.124e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 KMT5C-204ENST00000460956 637 ntTSL 515.77■□□□□ 0.124e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 04e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.014e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.034e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TLE3-209ENST00000557919 4294 ntTSL 514.56□□□□□ -0.084e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.124e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.24e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TLE3-221ENST00000560525 3647 ntTSL 513.4□□□□□ -0.264e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.274e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TLE3-225ENST00000561453 3719 ntTSL 513.33□□□□□ -0.284e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.294e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.383e-15■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.394e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 PCBP2-225ENST00000553064 1786 ntTSL 512.59□□□□□ -0.394e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.434e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 PCBP2-201ENST00000359282 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.54e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TLE3-213ENST00000558379 2304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.544e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 KMT5C-209ENST00000587442 464 ntTSL 311.54□□□□□ -0.564e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 MICA-208ENST00000421350 1005 ntTSL 511.47□□□□□ -0.573e-15■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TLE3-222ENST00000560589 3509 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.64e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TLE3-224ENST00000560996 495 ntTSL 511.13□□□□□ -0.634e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 PCBP2-204ENST00000439930 1296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.694e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 PCBP2-226ENST00000562264 1145 ntTSL 510.77□□□□□ -0.694e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 PCBP2-210ENST00000547859 1919 ntTSL 210.72□□□□□ -0.694e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 PCBP2-203ENST00000437231 3026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.774e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 PCBP2-205ENST00000447282 3077 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.84e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 PCBP2-206ENST00000455667 2741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.834e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 PCBP2-207ENST00000546463 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.864e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 PCBP2-223ENST00000552819 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.884e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 PCBP2-222ENST00000552296 1342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.934e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 PCBP2-218ENST00000550585 2543 ntTSL 59.03□□□□□ -0.964e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 PCBP2-219ENST00000550733 754 ntTSL 28.82□□□□□ -14e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 PCBP2-213ENST00000548933 1202 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.024e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 HCP5-201ENST00000414046 2658 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.163e-15■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 BRD8-215ENST00000460746 475 ntTSL 56.91□□□□□ -1.31e-11■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 PCBP2-209ENST00000547048 1696 ntTSL 26.24□□□□□ -1.414e-8■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 PRR14L-207ENST00000492705 548 ntTSL 214.3□□□□□ -0.121e-7■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 PRR14L-204ENST00000431684 2841 ntTSL 28.63□□□□□ -1.031e-7■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.096e-7■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 MINDY4-202ENST00000409881 2488 ntTSL 213.4□□□□□ -0.266e-7■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.223e-6■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 HDDC2-210ENST00000609574 607 ntTSL 216.42■□□□□ 0.223e-6■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 HDDC2-201ENST00000318787 1350 ntTSL 1 (best)16.06■□□□□ 0.163e-6■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.13e-6■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 HDDC2-206ENST00000608461 587 ntTSL 214.07□□□□□ -0.163e-6■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.163e-6■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 HDDC2-209ENST00000609477 564 ntTSL 414.07□□□□□ -0.163e-6■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.082e-19■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.882e-19■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 RPS6KA1-210ENST00000525525 543 ntTSL 526.73■■□□□ 1.872e-7■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 RPS6KA1-212ENST00000526040 500 ntTSL 526.73■■□□□ 1.872e-7■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.472e-7■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.422e-7■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 RPS6KA1-215ENST00000529454 544 ntTSL 514.91□□□□□ -0.022e-7■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.272e-7■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 RPS6KA1-209ENST00000524436 560 ntTSL 48.47□□□□□ -1.052e-7■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 RRP1-204ENST00000475534 588 ntTSL 322.21■■□□□ 1.151e-6■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 RRP1-206ENST00000492638 1017 ntTSL 216.87■□□□□ 0.291e-6■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 RRP1-205ENST00000483896 805 ntTSL 315.68■□□□□ 0.11e-6■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.031e-6■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.168e-7■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.395e-9■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 SOGA1-202ENST00000279034 3703 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.735e-9■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.554e-14■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.764e-14■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.764e-14■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.744e-14■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.254e-14■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 TSPAN3-209ENST00000560715 2892 ntTSL 26.78□□□□□ -1.324e-14■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 SLC25A44-201ENST00000359511 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.872e-7■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 SLC25A44-202ENST00000423538 3662 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.912e-7■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 SLC25A44-204ENST00000469537 6952 ntTSL 1 (best)8.83□□□□□ -12e-7■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 RN7SKP72-201ENST00000362327 292 ntBASIC9.44□□□□□ -0.99e-9■■□□□ 14.4
TARDBPQ13148 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.521e-6■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 TFDP2-209ENST00000477292 1403 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.951e-6■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 TFDP2-222ENST00000495310 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.091e-6■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.221e-6■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 ANXA1-207ENST00000491192 1400 ntTSL 1 (best)5.37□□□□□ -1.559e-7■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.599e-7■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.619e-7■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.12e-7■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 ASB1-203ENST00000438264 1048 ntTSL 317.68■□□□□ 0.422e-7■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 ASB1-209ENST00000491653 818 ntTSL 213.57□□□□□ -0.242e-7■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 ASB1-204ENST00000463352 569 ntTSL 312.77□□□□□ -0.372e-7■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 ASB1-205ENST00000468122 493 ntTSL 59.56□□□□□ -0.882e-7■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 AGPAT3-214ENST00000481319 616 ntTSL 314.73□□□□□ -0.057e-7■■□□□ 14.3
Retrieved 100 of 14,326 protein–RNA pairs in 200.4 ms