Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
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