Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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