Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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NPRL3Q12980 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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NPRL3Q12980 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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NPRL3Q12980 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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NPRL3Q12980 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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NPRL3Q12980 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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NPRL3Q12980 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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NPRL3Q12980 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
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NPRL3Q12980 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
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NPRL3Q12980 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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NPRL3Q12980 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPRL3Q12980 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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