Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TROQ12816 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TROQ12816 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TROQ12816 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TROQ12816 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TROQ12816 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TROQ12816 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TROQ12816 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TROQ12816 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TROQ12816 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TROQ12816 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TROQ12816 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TROQ12816 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TROQ12816 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TROQ12816 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TROQ12816 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TROQ12816 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TROQ12816 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TROQ12816 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TROQ12816 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TROQ12816 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TROQ12816 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TROQ12816 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TROQ12816 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TROQ12816 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TROQ12816 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TROQ12816 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TROQ12816 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TROQ12816 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TROQ12816 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TROQ12816 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TROQ12816 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TROQ12816 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TROQ12816 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TROQ12816 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TROQ12816 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TROQ12816 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TROQ12816 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TROQ12816 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TROQ12816 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TROQ12816 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROQ12816 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TROQ12816 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TROQ12816 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TROQ12816 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TROQ12816 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TROQ12816 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TROQ12816 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TROQ12816 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TROQ12816 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TROQ12816 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TROQ12816 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TROQ12816 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TROQ12816 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TROQ12816 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TROQ12816 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TROQ12816 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TROQ12816 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TROQ12816 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TROQ12816 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TROQ12816 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TROQ12816 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TROQ12816 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TROQ12816 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TROQ12816 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TROQ12816 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TROQ12816 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TROQ12816 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TROQ12816 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TROQ12816 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TROQ12816 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TROQ12816 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TROQ12816 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TROQ12816 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
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