Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EP300Q09472 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EP300Q09472 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EP300Q09472 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EP300Q09472 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EP300Q09472 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EP300Q09472 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EP300Q09472 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EP300Q09472 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms