Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms