Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NHLH2Q02577 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms