Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2B2Q01814 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms