Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MDM2Q00987 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms