Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01547P58512 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms