Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF3P57682 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLF3P57682 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms