Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BGRP55822 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms