Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AFDNP55196 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFDNP55196 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFDNP55196 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFDNP55196 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFDNP55196 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AFDNP55196 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFDNP55196 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFDNP55196 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFDNP55196 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AFDNP55196 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AFDNP55196 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AFDNP55196 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AFDNP55196 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AFDNP55196 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AFDNP55196 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AFDNP55196 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFDNP55196 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms