Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPAP49450 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPAP49450 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPAP49450 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPAP49450 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPAP49450 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPAP49450 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPAP49450 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPAP49450 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPAP49450 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPAP49450 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPAP49450 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPAP49450 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPAP49450 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPAP49450 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPAP49450 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPAP49450 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms