Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJA4P35212 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJA4P35212 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA4P35212 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA4P35212 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms