Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC1P33527 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC1P33527 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms