Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ME2P23368 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME2P23368 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME2P23368 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME2P23368 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME2P23368 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME2P23368 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME2P23368 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME2P23368 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME2P23368 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME2P23368 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME2P23368 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME2P23368 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME2P23368 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME2P23368 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms