Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGCP20142 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PGCP20142 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PGCP20142 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PGCP20142 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PGCP20142 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PGCP20142 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms