Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPRAP18433 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPRAP18433 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPRAP18433 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PTPRAP18433 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PTPRAP18433 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRAP18433 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRAP18433 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRAP18433 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRAP18433 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PTPRAP18433 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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