Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB1P16220 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CREB1P16220 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB1P16220 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB1P16220 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB1P16220 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms