Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA1P15085 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA1P15085 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA1P15085 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA1P15085 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA1P15085 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA1P15085 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA1P15085 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA1P15085 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA1P15085 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA1P15085 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA1P15085 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA1P15085 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms