Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM27P14373 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms